从陈云关于“摸着石头过河”的一系列论述来看，这一思想并非像有的人认为的那样，是不要理论指导的所谓“胡乱摸索”，而是在高度重视理论研究和顶层设计前提下的大胆探索、大胆试验、尊重规律、稳步前进的科学方法。
作为中国改革开放总设计师的邓小平，对“摸着石头过河”改革方法是完全赞同的。在邓小平看来，中国特色社会主义建设是一项前无古人的事业，既不可能在马列主义本本上找到现成答案，也没有任何现成的实践经验可以照搬照抄，所以只能“摸着石头过河”。在改革开放之初，邓小平就提醒我们：“我们现在所干的事业是一项新事业，马克思没有讲过，我们前人没有做过，其他社会主义国家也没有干过。所以，没有现成的经验可学，我们只能在干中学，在实践中摸索。”他还指出：“我们现在做的事都是一个试验，对我们来说，都是新事物，所以要摸索前进。”“大胆地试，大胆地闯。农村改革如此，城市改革也应如此。”由此看来，邓小平的思路和陈云是完全一致的。正因为如此，人们把“摸着石头过河”也视为邓小平的一个重要思想，看作是第二代中央领导集体的重要思想。
党的十八届三中全会和习近平总书记反复强调在全面深化改革过程中，要正确处理好“摸着石头过河”与“加强顶层设计”的辩证关系，在改革实践中把二者有机结合起来，其目的就是进一步要求人们不仅要注重加强对全面深化改革的顶层设计，而且还要继续摸着石头过河，通过不断摸索规律，在实践中获得真知，更加积极稳妥地把改革开放不断推向前进。
